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宿主的生物，包括生物体内防止疾病的许多生物结构和过程。为了正常运行，免疫系统必须检测从病毒到寄生虫的多种病原体，并将其与健康的人体组织区分开。在许多物种中，免疫系统包括两个主要子系统：先天免疫系统和适应性免疫系统。这两个子系统都使用体液免疫和细胞介导的免疫来执行其功能。在人类中，血脑屏障，血脑屏障和类似的脑间屏障将外周免疫系统与保护大脑的神经免疫系统分开。

病原体可以迅速进化和适应，从而避免了免疫系统的发现和中和；但是，还开发了多种防御机制来识别和中和病原体。甚至简单的单细胞生物（例如细菌）也具有酶形式的基本免疫系统，可以防御噬菌体感染。其他基本的免疫机制已在较老的真核生物中进化，并存在于其现代后代中，例如植物和无脊椎动物。这些机制包括吞噬作用，称为防御素的抗菌肽和补体系统。包括人类在内的下颌脊椎动物具有更复杂的防御机制[1]，包括随着时间的推移适应能力更有效地识别特定病原体的能力。适应性（或获得性）免疫在对特定病原体的初始反应后会创建免疫记忆，从而导致对随后与相同病原体相遇的反应有所改善。获得性免疫的这一过程是疫苗接种的基础。

免疫系统疾病可导致自身免疫性疾病，炎性疾病和癌症。 [2]当免疫系统的活性低于正常水平时，就会发生免疫缺陷，导致复发性威胁生命的感染。在人类中，免疫缺陷可能是由于遗传疾病（例如严重的联合免疫缺陷），获得性疾病（例如HIV / AIDS）或使用免疫抑制药物引起的。相反，自身免疫是由过度免疫的免疫系统引起的，该免疫系统攻击作为异物的正常组织。常见的自身免疫性疾病包括桥本氏甲状腺炎，类风湿性关节炎，1型糖尿病和系统性红斑狼疮。免疫学涵盖了免疫系统各个方面的研究。

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